Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
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