Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RNF185Q96GF1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RNF185Q96GF1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms