Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIRT1Q96EB6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms