Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPTSSAQ969W0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPTSSAQ969W0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms