Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NKD2Q969F2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms