Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PRG4Q92954 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PRG4Q92954 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms