Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RB1CC1Q8TDY2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RB1CC1Q8TDY2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms