Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHDC4Q8TBB5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms