Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC148Q8NFR7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC148Q8NFR7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC148Q8NFR7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC148Q8NFR7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC148Q8NFR7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC148Q8NFR7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC148Q8NFR7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC148Q8NFR7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC148Q8NFR7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC148Q8NFR7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC148Q8NFR7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC148Q8NFR7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC148Q8NFR7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC148Q8NFR7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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