Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF248Q8NDW4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF248Q8NDW4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF248Q8NDW4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF248Q8NDW4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF248Q8NDW4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF248Q8NDW4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF248Q8NDW4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF248Q8NDW4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF248Q8NDW4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF248Q8NDW4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF248Q8NDW4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF248Q8NDW4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF248Q8NDW4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF248Q8NDW4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF248Q8NDW4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF248Q8NDW4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF248Q8NDW4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF248Q8NDW4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF248Q8NDW4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF248Q8NDW4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF248Q8NDW4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms