Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AVL9Q8NBF6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms