Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDCL2Q8N4E4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms