Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNE4Q8N205 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNE4Q8N205 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms