Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC84Q86UT8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms