Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT28Q7Z3Y7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT28Q7Z3Y7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms