Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHST3Q7LGC8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHST3Q7LGC8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms