Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q71RC1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q71RC1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q71RC1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms