Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED13LQ71F56 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED13LQ71F56 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms