Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP31Q70CQ4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
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