Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP27Q6ZUM4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGAP27Q6ZUM4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGAP27Q6ZUM4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGAP27Q6ZUM4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGAP27Q6ZUM4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGAP27Q6ZUM4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGAP27Q6ZUM4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGAP27Q6ZUM4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP27Q6ZUM4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms