Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FAM43BQ6ZT52 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FAM43BQ6ZT52 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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