Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBR3Q6ZT12 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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