Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMARCD3Q6STE5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMARCD3Q6STE5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms