Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT80Q6KB66 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KRT80Q6KB66 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms