Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCSD1Q6JBY9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCSD1Q6JBY9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms