Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
INTS3Q68E01 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
INTS3Q68E01 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
INTS3Q68E01 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
INTS3Q68E01 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
INTS3Q68E01 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
INTS3Q68E01 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
INTS3Q68E01 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
INTS3Q68E01 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
INTS3Q68E01 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
INTS3Q68E01 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
INTS3Q68E01 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
INTS3Q68E01 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
INTS3Q68E01 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
INTS3Q68E01 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
INTS3Q68E01 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
INTS3Q68E01 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
INTS3Q68E01 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
INTS3Q68E01 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
INTS3Q68E01 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
INTS3Q68E01 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
INTS3Q68E01 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
INTS3Q68E01 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms