Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C9orf84Q5VXU9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms