Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GARNL3Q5VVW2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GARNL3Q5VVW2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms