Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIF1Q5UIP0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIF1Q5UIP0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms