Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HDGFL1Q5TGJ6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDGFL1Q5TGJ6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms