Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RSPH4AQ5TD94 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RSPH4AQ5TD94 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms