Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5Y3

CAMSAP1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP1Q5T5Y3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CAMSAP1Q5T5Y3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAMSAP1Q5T5Y3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms