Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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COL5A1-AS1Q5SY13 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
COL5A1-AS1Q5SY13 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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COL5A1-AS1Q5SY13 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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COL5A1-AS1Q5SY13 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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COL5A1-AS1Q5SY13 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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COL5A1-AS1Q5SY13 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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