Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC158Q5M9N0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms