Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CEP55Q53EZ4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms