Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBK1Q52WX2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms