Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC38Q502W7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC38Q502W7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms