Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
KRTAP21-1Q3LI58 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
KRTAP21-1Q3LI58 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms