Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KRTAP21-3Q3LHN1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRTAP21-3Q3LHN1 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms