Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CEACAM16Q2WEN9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms