Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC27Q2M243 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC27Q2M243 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms