Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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