Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
UPP1Q16831 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms