Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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PTPROQ16827 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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PTPROQ16827 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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PTPROQ16827 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPROQ16827 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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