Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDKN3Q16667 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDKN3Q16667 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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