Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
NREPQ16612 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
NREPQ16612 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
NREPQ16612 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NREPQ16612 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NREPQ16612 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NREPQ16612 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NREPQ16612 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NREPQ16612 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NREPQ16612 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NREPQ16612 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NREPQ16612 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NREPQ16612 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NREPQ16612 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NREPQ16612 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NREPQ16612 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NREPQ16612 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NREPQ16612 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms