Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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ZNF56Q15929 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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ZNF56Q15929 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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ZNF56Q15929 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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ZNF56Q15929 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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ZNF56Q15929 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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ZNF56Q15929 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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ZNF56Q15929 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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ZNF56Q15929 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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ZNF56Q15929 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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ZNF56Q15929 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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ZNF56Q15929 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ZNF56Q15929 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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