Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CHRNA6Q15825 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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