Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIP13Q15645 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms