Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RABEP1Q15276 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RABEP1Q15276 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
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